Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7P3

CLDN22, Claudin-22, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN22Q8N7P3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CLDN22Q8N7P3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CLDN22Q8N7P3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CLDN22Q8N7P3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CLDN22Q8N7P3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CLDN22Q8N7P3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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