Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LNX2Q8N448 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms