Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
P3H3Q8IVL6 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
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