Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PLD3Q8IV08 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLD3Q8IV08 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLD3Q8IV08 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLD3Q8IV08 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLD3Q8IV08 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLD3Q8IV08 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLD3Q8IV08 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLD3Q8IV08 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLD3Q8IV08 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLD3Q8IV08 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLD3Q8IV08 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLD3Q8IV08 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLD3Q8IV08 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLD3Q8IV08 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLD3Q8IV08 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PLD3Q8IV08 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLD3Q8IV08 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLD3Q8IV08 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLD3Q8IV08 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PLD3Q8IV08 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLD3Q8IV08 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLD3Q8IV08 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLD3Q8IV08 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLD3Q8IV08 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PLD3Q8IV08 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PLD3Q8IV08 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PLD3Q8IV08 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLD3Q8IV08 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLD3Q8IV08 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms