Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW2

SLC51B, Organic solute transporter subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC51BQ86UW2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SLC51BQ86UW2 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SLC51BQ86UW2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLC51BQ86UW2 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLC51BQ86UW2 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLC51BQ86UW2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLC51BQ86UW2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SLC51BQ86UW2 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms