Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CMC1Q7Z7K0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms