Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC80Q76M96 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms