Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Q71RC1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Q71RC1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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