Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6P435 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q6P435 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q6P435 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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