Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
REEP3Q6NUK4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
REEP3Q6NUK4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms