Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
WSCD1Q658N2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
WSCD1Q658N2 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms