Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FRMPD1Q5SYB0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FRMPD1Q5SYB0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms