Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.64
CEP170Q5SW79 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CEP170Q5SW79 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms