Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBN2

TRIM61, Putative tripartite motif-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM61Q5EBN2 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM61Q5EBN2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms