Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CAVIN4Q5BKX8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms