Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ODF2Q5BJF6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms