Protein–RNA interactions for Protein: Q56A73

SPIN4, Spindlin-4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN4Q56A73 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIN4Q56A73 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms