Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM259Q4ZIN3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms