Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZBED5Q49AG3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms