Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
MSMPQ1L6U9 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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