Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NTRK2Q16620 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NTRK2Q16620 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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