Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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ZNF239Q16600 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ZNF239Q16600 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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