Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SGCBQ16585 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SGCBQ16585 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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SGCBQ16585 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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SGCBQ16585 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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SGCBQ16585 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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SGCBQ16585 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SGCBQ16585 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SGCBQ16585 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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