Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PCSK7Q16549 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PCSK7Q16549 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms