Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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DDB1Q16531 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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DDB1Q16531 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
DDB1Q16531 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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DDB1Q16531 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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DDB1Q16531 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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DDB1Q16531 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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DDB1Q16531 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DDB1Q16531 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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