Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NTRK3Q16288 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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