Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 3,267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPEGQ15772 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms