Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
TWIST1Q15672 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TWIST1Q15672 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms