Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIP13Q15645 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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TRIP13Q15645 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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