Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
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SIX1Q15475 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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SIX1Q15475 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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SIX1Q15475 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SIX1Q15475 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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