Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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PCLAFQ15004 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCLAFQ15004 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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