Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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COL19A1Q14993 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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COL19A1Q14993 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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COL19A1Q14993 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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COL19A1Q14993 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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COL19A1Q14993 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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COL19A1Q14993 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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COL19A1Q14993 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COL19A1Q14993 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms