Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
COL9A3Q14050 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
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