Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GTF2H2Q13888 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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GTF2H2Q13888 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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