Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
DDX39BQ13838 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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