Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ALCAMQ13740 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ALCAMQ13740 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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