Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CUL4BQ13620 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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