Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AL121972.2-201ENST00000431108 556 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AC004918.1-201ENST00000467537 770 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 ZNF626-201ENST00000291750 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 POLR2K-201ENST00000353107 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 MRPL47-202ENST00000392659 673 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MKRN4PQ13434 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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