Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTGDRQ13258 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms