Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CBX3Q13185 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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