Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CALCOCO2Q13137 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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CALCOCO2Q13137 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CALCOCO2Q13137 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CALCOCO2Q13137 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CALCOCO2Q13137 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CALCOCO2Q13137 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CALCOCO2Q13137 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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CALCOCO2Q13137 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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CALCOCO2Q13137 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CALCOCO2Q13137 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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