Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GPS1Q13098 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GPS1Q13098 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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