Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 Z97985.1-201ENST00000332270 946 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKRN3Q13064 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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