Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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PTPRJQ12913 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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PTPRJQ12913 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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PTPRJQ12913 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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PTPRJQ12913 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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PTPRJQ12913 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRJQ12913 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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