Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GRIN2AQ12879 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GRIN2AQ12879 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
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