Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NFIAQ12857 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NFIAQ12857 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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