Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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BPTFQ12830 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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BPTFQ12830 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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BPTFQ12830 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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BPTFQ12830 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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BPTFQ12830 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BPTFQ12830 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BPTFQ12830 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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