Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TFCP2Q12800 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TFCP2Q12800 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms