Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOBRQ0VD83 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
APOBRQ0VD83 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms