Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CACNB2Q08289 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CACNB2Q08289 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms